המסתם האיילוצקלי הוא מבנה הגבול האנטומי בין החלק הסופי של המעי הדק, הנקרא אילום, וחלקו הפרוקסימלי של המעי הגס, הנקרא cecum. ההתאמה הדו -כיוונית המסויימת של המסתם האיילוקצלי בגופה - המאופיינת בנוכחות שני דשי רירית שמקורם באילום כדי לבלוט, כמו השפתיים, לתוך לומן המעי הגס - הביאה את החוקרים לפרש מבנה זה כממשי מכשיר על פי תיאוריה זו, שנחשבת כיום בעיני רבים כבלתי נכונה או לפחות לא מדויקת, לשסתום האיילוקקלי יש מטרה כפולה:
האטה, סגירה, מעבר התוכן האליאלי אל תוך המעי הגס, הגדלת זמן השהייה של השימון באתר האליאלי האחראי לספיגה של חומרים מזינים שיוריים;
מתן אפשרות לפתיחת זרימת תכולת המעיים מהמעי הדק אל המעי הגס;
מניעה, על ידי סגירה, של ריפלוקס של תוכן המעיים מהמעי הגס למעי הדק; זהו תפקידו העיקרי של המסתם אשר - במקרה של תקלה - הוא אחד הגורמים האחראים לתסמונת הזיהום החיידקי של המעי הדק. למעשה, מילוי המעי הגס מגביר את לחץ החנקה ונוטה לדחוף את החומר הצואה בחזרה אל דשי השסתום, ולגרום להם להיסגר.
מכאן שסתום השם. עם זאת, כמה ספרי לימוד עדכניים יותר מדגישים כיצד המסתם האיילוקצלי כמתואר לעיל הוא זכות הגופה ואינו קיים בקרב החיים. תפקיד השסתום הנ"ל יכוסה לא רק על ידי דשי המסתם האיילוקצלי עצמו, אלא על ידי הקלה מעוגלת הנגרמת על ידי מניוקוטו של סיבי שריר חלקים היוצרים מעין סוגר, הידוע כיום בשם הסוגר האיילוקצלי.