לנוגדנים אנטי -גרעיניים יש חשיבות רבה בתחום הרפואי, שכן - גם אם הם נמצאים בכמויות קטנות אצל אנשים בריאים רבים - הם נוטים לעלות באופן משמעותי בדם של נבדקים שנפגעו ממחלות אוטואימוניות מערכתיות (CORN).
לדוגמה, כמעט כל החולים עם זאבת מערכתית או מחלת רקמת חיבור מעורבת בודקים חיוביים ל- ANA.
ישנם מספר מרכיבים סלולריים שאליהם נרשמת התקפת נוגדנים אנטי -גרעיניים.
המונח אנטי -גרעיני קשור לכך שהנוגדנים הראשונים שהתגלו כוונו נגד אנטיגנים גרעיניים. כיום, נוגדן נגד גרעין הוא טרמינולוגיה מיושנת, שכן מספר מטרות אוטואנטיגניות, החשובות מבחינה קלינית בכמה מחלות אוטואימוניות מערכתיות, ממוקמות גם בציטופלזמה (ולכן מחוץ לגרעין).
כצפוי, ישנם סוגים שונים של נוגדנים נגד גרעין, המסווגים לפי האנטיגנים העצמיים שאליהם הם מכוונים. לכל אחד מהנוגדנים הללו יש ייחודיות מסוימת לכמה פתולוגיות אוטואימוניות; המשמעות היא שהעלאת ערכי הדם שלו היא אזהרה המעידה על נוכחות אפשרית של מחלה ספציפית מאוד.
הנוכחות של ANA יכולה להיחשב כסימן לתהליך אוטואימוני ומאפשרת לשלול מצבים אחרים עם סימנים ותסמינים דומים. המחלה בה הם נמצאים בתדירות הגבוהה ביותר היא זאבת מערכתית (SLE).
;
הערה
בדיקת ANA אינה משמשת כדי לעקוב או לעקוב אחר מהלך הקליני של SLE, כך שבדרך כלל אין צורך בבדיקה זו באופן סדרתי.