חומצת הגרעין סגורה במעין מיכל או ציפוי, הנקרא הקפסיד ומורכב מחזרה על יחידות משנה של חלבון, הנקראות כובשים, בתורו נוצר על ידי חזרה על חלבון אחד, שניים או יותר. בנגיף הפפילומה, למשל, הקפסיד בנוי מכמה עותקים של שני חלבונים שונים, L1 ו- L2; הראשון, השופע יותר, הוא בעל יכולת צבירה עצמית ויצירת וירונים נטולי חומצות גרעין (הוא מאוד אימונוגני ולכן משמש כבסיס לייצור חיסונים).
ה הליבה מבטיח לנגיף את היכולת לבצע את תהליכי הכפל והצמיחה, בעוד שהקפסיד נותן צורה ויציבות לחלקיק הנגיפי, מגן על הגנום שלו וחשוב להדבקות (הודות לנוכחות מבנים אנטי קולטן).
יחדיו, קפסיד וחומצה גרעינית יוצרים את נוקלאוקפסיד.
בטבע ישנם וירוסים הנוצרים רק על ידי חומצות גרעין וקפסיד, ומסיבה זו נקראים "וירוסים עירומים"; בקטריופאגים הם דוגמה לנגיפים עירומים. ישנם גם חלקיקים ויראליים אחרים המציגים, בנוסף לקפסיד, קרום חיצוני ביותר, הנקרא pericapsid, peplos או גלימה (מַעֲטָפָה), הנובע מממברנת הפלזמה של התא המארח וככזה מורכב בעיקר מפוספוליפידים, אך גם מפוליסכרידים וחלבונים (בדרך כלל גליקופרוטאינים). וירוסים עם pericapsid נקראים "וירוס מצופה"ובאופן כללי יש גם מבנה חלבון, הנקרא מטריצה או אינטגרמנט, הממוקם בין הקפסיד לפריקפסיד.
וירוסים מצופים - הודות לפוספוליפידים pericapsid - חודרים ביתר קלות לתאים רגישים ומפחיתים את התגובה החיסונית של המארח; ה adenovirus, האחראי לדלקת הלחמית ולסימפטומים של parainfluenza, הוא דוגמה לנגיף מצופה, כמו כל הנגיפים האחרים.
הקפסיד הנגיפי יכול בדרך כלל להניח שתי קונפורמציות שונות, המאופיינות באחת מבנה מסוג icosahedral אוֹ סליל.
נגיף הטבק פסיפס הוא דוגמה אופיינית לנגיף מבנה סליל, בעוד שלנגיף הפפילומה יש מבנה איקוסאהדראלי. ישנם גם וירוסים בהם הקפסיד חסר סימטריה ובעל מורפולוגיה מעורבת (כגון נגיף ה- HIV, המורכב מקפסיד איקוסאהדראלי ומליבה נימה של חומצת גרעין).
סיווג וירוסים
כל וירוס מזוהה על ידי מין, סוג ומשפחה. לדוגמה, אם ניקח את נגיף ה- HIV, המינים מציינים את השם הנפוץ של המיקרו -גראניזם, כלומר נגיף חסר חיסוני נרכש או, מדויק, HIV. וירוס זה שייך לסוג lentivirus (כלומר עם מחזור צמיחה איטי) ולרטרו -וירדיים משפחה (רטרו -וירוסים הם וירוסים עם מחזור שכפול המאופיין בשתי צורות של חומצת גרעין, המציגות אנזים הנקרא טרנסקריפטאז הפוך, המסוגל לבצע שעתוק הפוך שהופך את ה- RNA הנגיפי ל- DNA).
לאחר מכן מתואר כל מין ויראלי על בסיס המבנה (גודל, מורפולוגיה וסוג חומצת גרעין), סוג השכפול (גרעיני או ציטופלסמי), התא המארח (בעלי חיים, פטריות, צמחים או חיידקים), טרופיזם של רקמות או איבר וסוג ההעברה (צואה-אוראלית, פרנטרלית וכו ').
חיסונים אנטי ויראליים
חיסונים אנטי -ויראליים יכולים להיות מורכבים מוירוסים (מופעלים) מוחלשים (הם שמרו על היכולת לשכפל אך איבדו הרבה מהפוטנציאל הפתוגני שלהם) או מתתי יחידות ויראליות (חיסונים מהדור החדש נוצרים, למשל, מחלבונים pericapsid ויראליים, מסוגל לעורר חסינות פסיבית). תכשיר מדור חדש הוא חיסון הפטיטיס B, המבוסס אך ורק על גליקופרואין קפסיד של נגיף HBV.
מאמרים נוספים בנושא "מבנה וסיווג וירוסים"
- נגיף
- ריבוי וירוסים
- מחלות הנגרמות על ידי וירוסים ותרופות אנטי ויראליות
